V roce 1886 byl založen Historický a archeologický spolek Komárňanské župy a města Komárna. Shromážďoval dokumenty k napsání monografie župy, archeologické a historické památky. Zbírka téhož spolku tvořila základ pozdějšího muzea. V roce 1900 dostal spolek nový název Muzeálný spolek Komárňanské župy a města Komárna. Na místech tehdejší zbírky starožitností Muzeálný spolek vytvořil čtyři oddělení: historické, archeologické, prířodopisné a národopisné. Významným mezníkem v životě muzea byl rok 1911, když sloučením Muzeálního spolku se Vzdělávacím spolkem a Župní knižnicí byl vytvořen Jókaiho vzdělávací a muzeálný spolek. V roce 1913 byla na základě projektů budapešťanského univ. prof. Dezső Hültla postavěna nová účelová budova Jókaiho spolku – Kulturní palác, dnešní sídlo muzea.